А что самозанятые платят с поступлений? Не с суммы реализации?
По логике и правилам бух.учета,если ИП на упрощенке, то как правило ИП использует кассовый метод подсчёта доходов и расходов, и тогда логичнее платить с суммы,поступившей на расч.счет.Но получается,что работа на МП - это исключение из правил, раз налоговики требуют от ИП корректировки и доплатить