Можешь в фш на нужных тебе слоях добавить какой-нить префикс, imp_ например, закинуть псд в ае, в поиске набрать этот префикс, чтоб он показал тебе нужные слои, перенести их в новую отдельную папку, удалить старую в оставшимися слоями. Так будет меньше копий и если что сможешь оригинал псд открывать и там корректировать его