Можно и нужно ставить на физический интерфейс mtu максимально большое, по аналогии с микротом, это будет l2 mtu, чтобы самого себя не ограничивать в будущем
Если поставить на сабинтерфейс mtu 1500, то будет скорее всего в большинстве случаев нормально работать
То есть
Eth -> 9000
Eth.svlan -> 1500
Eth.svlan.cvlan -> 1500
Ipoexxxx -> 1500
Правильнее, конечно:
Eth -> 9000 (1508, кто как хочет)
Eth.svlan -> 1504
Eth.cvlan -> 1500
Ipoexxxx -> 1500
Абонентам mtu только 1500 делать, иначе будут нюансы со всяким дешёвым оборудованием
Касательно первоначального вопроса, правильнее указывать в конфига, но можно и не указывать, ведь размер фреймов будет зависеть только от mtu ipoexxxx и надо, чтобы тегированные фреймы не превышали размеры mtu физического интерфейса
я тоже раньше считал, пока не столкнулся с оборудованием у которого буффер зависит от mtu (чем больше назначенный mtu, тем меньше буфер в пакетах)