есть просто комп, дебчик, находится в локальной сети, ходит только на "свои" сайты, запущена в основном прога для работы (на джаве), читается почта, ну и всякие офисные проги
есть поверхностные методы, грепы всякого подозрительного составляющего, есть более "продвинутые" методы, вроде анализа соотношения кода к строкам, но все это сводится к поиску ожидаемого или предсказуемого