ОК. Понял.
Если можно, сделайте сравнение с выключеным афр в обоих приложениях.
Проверил. С отключенным АФР оба приложения ведут себя одинаково плохо. С включенным АФР штатный Ютуб 2.00.19 показывает все гладко. А СмартЮтуб то дергаетя, то нет. Перемотал чуть назад - может стать плавно. Еще раз назад - опять как повезет. Заодно что обнаружил: достаточно нажать на паузу и дергание может прекратиться; если не с первого, то со второго раза. И наоборот, плавное видео после короткой паузы может задергаться. Заодно поставил версию 6.16.86, все тоже.
В настройках СмартЮтуба галка АФР отключена, т.к. ни на что не влияет.