Тут нет лучшего решения
1. Маленький размер одного плотфайла выгоден тем, что если будет поврежденные блоки, не нужно удалять один файл на ТБ, а лишь маленький плот. Второй момент, это удобство переноса с одного диска на другой плот файлов
2. Большой размер плотфайла предпочтителен для того, чтобы быстрей считывать информацию с диска, осуществляя поиск в одном файле, а не в 100. Также для здоровья жесткого диска, говорят разрабы, полезней больший файл плота. Но его недостатки описаны в 1 пункте