Не, идея разделить. PQ визуально используют аналитики, и вставляют в готовый SSIS пакет.
А как это поддерживать потом? Скажем, через год этот код кто-то новый откроет и попытается разобраться.
Нужно будет вставлять обратно в PowerQuery editor, как я понимаю. Если регламентировать, то мб и ок, но мне кажется, не совсем прозрачно.