а покажите весь rs.status() ?

сек

mongo-master ~ # mongo
MongoDB shell version: 3.0.10
connecting to: test
actr:PRIMARY> rs.status()
{
 "set" : "actr",
 "date" : ISODate("2016-05-04T13:45:03.798Z"),
 "myState" : 1,
 "members" : [
   {
     "_id" : 0,
     "name" : "1.2.3.4:27017",
     "health" : 1,
     "state" : 1,
     "stateStr" : "PRIMARY",
     "uptime" : 1124613,
     "optime" : Timestamp(1462369502, 3),
     "optimeDate" : ISODate("2016-05-04T13:45:02Z"),
     "electionTime" : Timestamp(1461245375, 1),
     "electionDate" : ISODate("2016-04-21T13:29:35Z"),
     "configVersion" : 47573,
     "self" : true
   },
   {
     "_id" : 1,
     "name" : "1.2.3.5:27017",
     "health" : 1,
     "state" : 9,
     "stateStr" : "ROLLBACK",
     "uptime" : 143156,
     "optime" : Timestamp(1461243514, 7),
     "optimeDate" : ISODate("2016-04-21T12:58:34Z"),
     "lastHeartbeat" : ISODate("2016-05-04T13:45:02.126Z"),
     "lastHeartbeatRecv" : ISODate("2016-05-04T13:45:03.306Z"),
     "pingMs" : 0,
     "syncingTo" : "1.2.3.4:27017",
     "configVersion" : 47573
   },
   {
     "_id" : 2,
     "name" : "1.2.3.6:27017",
     "health" : 1,
     "state" : 7,
     "stateStr" : "ARBITER",
     "uptime" : 1123842,
     "lastHeartbeat" : ISODate("2016-05-04T13:45:02.809Z"),
     "lastHeartbeatRecv" : ISODate("2016-05-04T13:45:03.146Z"),
     "pingMs" : 0,
     "configVersion" : 47573
   }
 ],
 "ok" : 1
}

actr:PRIMARY> db.printReplicationInfo()
configured oplog size:   51200.00352478027MB
log length start to end: 2425597secs (673.78hrs)
oplog first event time:  Wed Apr 06 2016 15:28:25 GMT+0300 (MSK)
oplog last event time:   Wed May 04 2016 17:15:02 GMT+0300 (MSK)
now:                     Wed May 04 2016 17:15:02 GMT+0300 (MSK)

вот это вы зря. Больше недели это однозначно не нормальное время, по доке, данных для ролбека не может быть больше 300ьи

mb

какие советы будут

я подумываю о разрыве реплики и поторном копировании базы

и ещё момент

мастер останавливать не вкоме случае нельзя

тоесть при копировании я скопирую лок файл

не может ли эта байда быть из за него?

Попробуйте убрать файлы rollback'a, они там где-то рядом с файлами бд. Только не удаляйте, а просто переместите куда нить.  Но это на свой страх и риск. Но раз вы неделю потерю данных не обнаружили, вряд ли там что-то ценное, даже если оно там есть

When a rollback does occur, MongoDB writes the rollback data to BSON files in the rollback/ folder under the database’s dbPath directory.

в принципе, данные не потеряны, вы можете почитать их bsondump'ом

это про слейв речь так?

про тот, который сейчас ROLLBACK

слей

он был MASTER