Лучше делай через Avisynth - там одной командой из файлов собирается CoronaSequence - далее можно добавить интерполяцию кадров и потом скрипт открыть в любом плеере или редакторе - будет играть как обычное видео и можно будет сохранить в любой формат как обычно
/Users/mrpingwi/Desktop/moeemoe/ffmpeg -start_number 0001 -i "ВОТ ТУТ АНУЖНО УАЗТЬ ПУТЬ ГДЕ ЛЕЖАТЬ КАРТИКИ! ТОЛЬКО ПУТЬ ДО ПАПКИ"moemoe_%d.png -vcodec mpeg4 moemoe.avi