С установкой под Linux проблем действительно нет. Там другая проблема в переходе со 2 версии на 3: очень много было создано полезных библиотек под 2 версию, которые до сих пор не были портированы, либо не созданы их аналоги. Т.е. выбор версии питона зависит от тех библиотек, которые вам нужны.
а, в этом плане есть проблема с версиями, да. я хз, но мне кажется, что это может быть обусловлено тем, что мало бабла, т.к. поддержка совместимости стоит денег на разработку. с другой стороны, может это личные загоны разрабов языка, хотели начать типа с нуля.