Нет никакой разницы. И где вы видели информацию что разработчик говорит удалить старую версию прежде чем новую загрузить при обновлении?
согласен. чудеса очень редки. удалять смысла особого нет, если сильно хочется можно очистить данные приложения. вообще все это шаманизм и бубноведение.
С другой стороны, ну попросило приложение обновиться, закрыл и корми своих демонов, кто мешает? Зачем что то отключать?