Протон от стима ещё интереснее, напоминает костыль для костыля. Там была приколюха в 5.22, вроде, когда юзался json файл для того, чтобы сохранить настройки приложения внутри префикса, но он почему-то подключал в гноме пару либ от кедов и забывал их выгрузить.