Ну вы посмотрите нет ли лишних продуктов в настройках всуса.
Еще хинт туда же: если вы отключаете продукт, это не значит что обновления удаляются
нет, ну на сервер сайта, sql sccm, на все клиентские ПК и сервера приходят обновы, а на сам сервер с ролью WSUS нет)