Питание на порты USB подаётся от одного внутреннего источника питания. Ну ещё один подвешенный хард как-то тянет, а на два его, вероятно, не хватает и питание проседает по уровню. Что и сказывается на остальных устройствах, работающих от портов. Если у вас есть универсальные USB-свистки измерители тока и напряжения, попробуйте подключить и посмотреть как себя ведут их показания.